第一类是纯粹数据管理型，这类的LIMS软件主要功能一般包括：数据采集、传输、存贮、处理、数理统计分析、数据合格与否的自动判定、输出与发布、报表管理、网络管理等模块。但其功能单一，容易实现。

       第二类是实验室全面管理型，除了具有第一类的功能外，还增加了以下管理职能：样品管理、资源(材料、设备、备品备件、固定资产管理等)管理、事务(如工作量统计与工资奖金管理、文件资料和档案管理)管理等模块，组成了一套完整的实验室综合管理体系和检验工作质量监控体系。其功能比较全面，除了能够实现对检验数据严格管理和控制外，还能够满足实验室的日常管理要求;网络结构相应要复杂一些，实现起来要困难一些，投资比较大，而且往往需要专业单位与实验室合作开发设计。